Magíster en Ciencias con Mención en Pesquerías

Oceanografía pesquera

Esta asignatura entrega al alumno fundamentos y herramientas para comprender y poder diseñar investigaciones acerca de la influencia del ambiente sobre los recursos marinos vivos tendientes a mejorar su manejo. El curso, con un fuerte énfasis interdisciplinario, abarca procesos físicos y biológicos de diversas escalas espaciales y temporales (desde microescala a macroescala, incluyendo procesos ambientales a escala global como el cambio climático) que afectan la distribución, el reclutamiento, la abundancia de las poblaciones de recursos y su permanencia en el tiempo. Al final del curso, los estudiantes deberán ser capaces de identificar, proponer métodos y herramientas de estudio de estos procesos y, a la vez, podrán identificar, comprender y prever potenciales impactos antropogénicos sobre los recursos y ecosistemas marinos, en el contexto de la variabilidad natural de los sistemas.

Biología de poblaciones

La asignatura aborda enfoques teórico-prácticos del estudio de los organismos acuáticos, sus ambientes y estrategias de uso pesquero o acuícola. El curso aborda el conocimiento sobre los organismos acuáticos generado desde múltiples disciplinas científicas, como ecología, genética, genómica, taxonomía y fisiología, con aquellos de las ciencias aplicadas, como la biología de la conservación o la acuicultura, considerando un escenario de cambio global. La asignatura incluye las bases teóricas de la dinámica de poblaciones, tanto en aquellas sometidas como no sometidas a explotación. Se enfatizan métodos cuantitativos que permitan comprender y pronosticar los cambios en la abundancia de las poblaciones en múltiples escalas temporales y espaciales. La asignatura busca formar graduados capaces de conjugar enfoques biológicos y cuantitativos en el estudio de la dinámica, conservación y gestión de organismos acuáticos, tanto nativos como introducidos.

Fundamentos de la investigación científica

Asignatura de carácter teórico-práctico que permite al estudiante familiarizarse con las líneas de investigación desarrolladas por docentes del programa en tópicos de frontera en Ciencias Pesqueras. Los tópicos seleccionados corresponden a cuatro líneas de investigación del Programa. Los estudiantes deberán leer los trabajos de investigación recientes en cada uno de estos campos y discutir las problemáticas asociadas a la investigación. Se abordarán las metodologías y fundamentos de la investigación, comunicación científica y el desarrollo y evolución de paradigmas científicos.

Evaluación de stock

Este curso del ciclo básico del Programa de Magíster en Ciencias con Mención en Pesquerías está estructurado para que los alumnos fortalezcan sus capacidades cuantitativas en estadística, programación y modelación para abordar preguntas y hacer inferencia respecto de una variedad de ámbitos de las ciencias pesqueras, incluyendo estimación de abundancia de organismos de vida libre y dinámica espacio-temporal de recursos marinos explotados. Al final del curso, el estudiante debe ser capaz de comprender, diseñar, enfrentar y realizar evaluaciones de stocks pesqueros, tanto por métodos de muestreo directo en la naturaleza como por análisis de modelos matemáticos utilizando información proveniente de diversos programas de levantamiento de información.

Administración pesquera

Esta asignatura entrega conocimiento y herramientas para la gestión y manejo de recursos pesqueros con énfasis en un enfoque ecosistémico a la pesca, así como en una gobernanza pesquera entendida como parte integral de sistemas socio-ecológicos complejos. El curso promueve en los estudiantes, además, un compromiso ético con la sostenibilidad de los recursos hidrobiológicos y de los ecosistemas, promoviendo el desarrollo sostenible de la actividad pesquera, la aplicación del principio precautorio para la conservación de los recursos acuáticos y la minimización del impacto sobre los ecosistemas marinos. El curso está compuesto de dos módulos, a saber: Conceptos fundamentales del manejo pesquero (Módulo I), e Introducción a la economía pesquera (Módulo II).

Seminario proyecto de tesis

Esta asignatura es la continuación de “Fundamentos de la Investigación Científica” y está destinada a desarrollar una propuesta original e individual de investigación científica sobre un tema o problema del área principal declarada de interés. El resultado de esta asignatura es la elaboración del Proyecto de Tesis y su defensa.

Elementos para la evaluación de estrategias de manejo de recursos pesqueros

El propósito principal del manejo de recursos pesqueros es fomentar la explotación racional de ellos, logrando su sustentabilidad en el largo plazo, así como de las pesquerías y otras actividades que de ellos dependen. El manejo pesquero es un proceso complejo que involucra una amplia variedad de grupos de interés, usualmente con diferentes orientaciones, conocimientos, roles y objetivos. La toma de decisiones en el manejo pesquero se beneficia del aporte de la ciencia respecto del conocimiento del estado y tendencia de los recursos, tanto del pasado como en el futuro, bajo decisiones alternativas de manejo. Tradicionalmente, el apoyo científico para el manejo de recursos pesqueros se ha basado en uno o un grupo reducido de modelos de dinámica poblacional que se considera reúnen los mejores supuestos, análisis y datos disponibles al momento de realizar las asesorías. Este enfoque ha resultado problemático debido a sesgos en los modelos, la variabilidad de sus resultados no relacionados a cambios poblacionales, inconstancia en la implementación de los resultados de los modelos en acciones de manejo, tendencia a un enfoque cortoplacista, incompleta o incorrecta incorporación de incertidumbre y riesgo. Las estrategias de manejo son las combinaciones integradas y pre acordadas de los datos, los análisis de esos datos y la regla de control de captura utilizada para determinar las acciones de manejo. El proceso de Evaluación de Estrategias de Manejo (EEM, o MSE por sus siglas en Ingles) es considerado el más apropiado para evaluar costos y beneficios esperados entre estrategias de manejo alternativas, integrando múltiples fuentes de incertidumbre, para lograr los objetivos de manejo propuestos. Aunque parte del proceso de evaluación de estrategias de manejo es altamente técnico y desarrollado por científicos cuantitativos a través de simulaciones computacionales, otra parte igualmente importante involucra a otros grupos de interés (tales como administradores, gente de la industria, los pescadores o sus representantes), por ejemplo en la definición de objetivos de manejo, las métricas de desempeño y las estrategias a evaluar. Vale decir, es fundamental que todos los participantes comprendan los elementos básicos, la mecánica y los roles de cada participante en el proceso de EEM. La asignatura/taller propuesto tiene como capacitar a los estudiantes en los componentes, el diseño y el proceso de evaluación de estrategias de manejo de recursos pesqueros, tanto en aspectos genéricos, como también abordando casos de estudio particulares. La asignatura está organizada en una serie de sesiones virtuales de media jornada de duración, alternando sesiones teóricas conceptuales y sesiones prácticas donde se demostrará de manera interactiva casos genéricos y casos de estudio sobre diseño utilizando entre otros el paquete estadístico R, MS Excel y la plataforma de modelado Stock Synthesis. Para las actividades demostrativas e interactivas también se utilizará una herramienta/aplicación Shiny en línea (online), la cual simula el ciclo completo de evaluación de estrategias de manejo bajo diferentes supuestos y configuraciones de proyección y manejo.

Evaluación y manejo de pesquerías limitadas en datos

El manejo pesquero se identifican procedimientos de manejo (PM), definidos por: a) un sistema de recolección de datos, b) un estimador de la situación del stock, o indicador; y c) una regla de control de captura. La regla de control se basa en estrategias de explotación genéricas, y puntos biológicos de referencia objetivos y límites. Muchas de las pesquerías actuales carecen de observaciones sistemáticas de datos, lo que impone desafíos para la evaluación y manejo. En esta asignatura, se capacitará en la aplicación de modelos de evaluación de pesquerías limitadas en datos.

Fitting hierarchical models to ecological data with tmb

La asignatura orientada al desarrollo de herramientas cuantitativas para el análisis de datos ecológicos utilizando plataformas de vanguardia en la estimación lineal y no lineal de parámetros. La plataforma “Template Model Builder” (TMB) se propone como un recambio del prestigiado programa ADMB (Automatic Differentiation Model Builder, www.admb-project.org), que se puede operar íntegramente desde R y que permite implementar eficientemente complejos modelos estadísticos. En esta asignatura se implementarán modelos estadísticos y se aprenderá a ajustarlos mediante métodos de máxima verosimilitud. Estos modelos cubrirán un amplio rango, desde modelos con efectos fijos, aleatorios y mixtos (i.e., modelos jerárquicos). Se trabajará con datos propios y de la asignatura para practicar el proceso de estimación de parámetros de modelos en R

Application of bioenergetics models to research & management

Bioenergetics models provide a useful framework for mechanistically determining what factors affect feeding and growth of aquatic organisms and for quantifying consumption under dynamic environmental and ecological conditions. These models allow us to examine what factors limit populations of interest (seasonal food supply, predation, competition, environmental conditions). In this course, you will acquire a conceptual understanding of bioenergetics principles, then learn to construct and apply bioenergetics models for fish and/or invertebrates to a wide array of management and research questions about trophic interactions, design supporting studies, and critically examine this approach and others through lecture, literature discussion, computer exercises, and projects.

Modelación estadística en ecología con énfasis en dinámica de poblaciones

La modelación estadística de los datos colectados por ecólogos y biólogos de las ciencias de mar de poblaciones naturales requiere del conocimiento de conceptos, métodos y herramientas de análisis matemático, estadístico y programacionales de los datos colectados, tanto en experimentos de laboratorio como en estudios observacionales en la naturaleza. Esta asignatura está orientado al desarrollo de herramientas cuantitativas para el análisis de datos ecológicos utilizando el lenguaje R, proporcionando a los estudiantes graduados las capacidades para analizar sus datos experimentales y observacionales para resolver preguntas de la dinámica de poblaciones tanto terrestres como marinas. La amplia experiencia del relator tanto en dinámica poblacional, modelación estadística y programación (autor de varias extensiones oficiales del lenguaje R) brindará a los estudiantes una cercanía tanto a los fundamentos como a la forma de resolver los problemas.

Ecología, genética y gestión de salmónidos (eggs)

Esta asignatura entregará a los alumnos las bases teóricas del ciclo de vida, comportamiento y las herramientas metodológicas prácticas en la evaluación y administración de salmones y truchas (i.e., salmónidos; familia Salmonidae), un carismático y bien estudiado grupo de peces originarios del hemisferio norte. Además de sustentar importantes pesquerías, los salmónidos son importantes sustratos de estudio en Ecología y Genética debido a (i) su variación en historias de vida, (ii) la extensa migración entre áreas de reproducción en aguas continentales y alimentación en aguas marinas, y (iii) la capacidad de retornar a desovar a los tributarios y/o lagos en que eclosionaron desde huevos 3 – 5 años antes. Se discutirá también las introducciones de salmónidos en el mundo, con énfasis en casos exitosos en varios continentes, donde hoy forman conspicuas poblaciones asilvestradas que han alterado significativamente los ecosistemas nativos, pero que benefician a comunidades de pescadores recreativos y artesanales