Doctorado en Bioquímica y Bioinformática

El programa de doctorado es de carácter diurno y presencial, tiene una duración de 4 años distribuidos en 8 semestres y es de dedicación exclusiva. En el plan de estudios del progr...

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Tipo

Doctorado

Carácter

Académico

Campus

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Perfil de graduación

¿Qué lograrás?

Quienes se gradúen de este programa estarán capacitados para enfrentar los desafíos actuales del entorno profesional.

Perfil del Graduado/a

El programa de Doctorado en Bioquímica y Bioinformática desarrollará competencias en los estudiantes en el ámbito de la investigación científica al formular y desarrollar proyectos de investigación básica y aplicada en estas áreas, manteniendo un firme compromiso con la excelencia en su trabajo. Asimismo, los/las estudiantes tendrán habilidades críticas para analizar y seleccionar información apropiada de diversas fuentes validadas, con el fin de fundamentar las investigaciones y formular argumentos sólidos a la hora de tomar decisiones. Ser capaz de integrar equipos multidisciplinarios de investigación y colaborar con otros investigadores a nivel nacional e internacional también es una habilidad esencial para los estudiantes del programa.

Finalmente, se espera que los graduados puedan comunicar efectivamente, mediante presentaciones orales, informes escritos o a través de los medios y tecnologías de la información y comunicación, los resultados y hallazgos de sus investigaciones, demostrando un manejo responsable y ético de la información.

Objetivos Específicos

Formar graduados con una sólida formación en Bioquímica y Bioinformática a través de asignaturas básicas y electivos de especialización.
Formar investigadores con la capacidad de generar conocimiento para resolver problemáticas científicas aplicando metodologías bioquímicas y bioinformáticas.
Desarrollar habilidades en los estudiantes para comunicar hallazgos científicos en forma oral y escrita.
Desarrollar experiencias de investigación colaborativa con laboratorios y centros de investigación e innovación nacionales e internacionales mediante estadías de investigación y asistencia a congresos de estudiantes y profesores.

Requisitos de Admisión

La elaboración y evaluación del examen de admisión será responsabilidad del comité del programa, el examen tendrá un 60% de exigencia y distintos tipos de preguntas. La elección del/los artículos/os científico/s (si es más de uno va a depender del número de postulantes y como se calendarizan las presentaciones), será responsabilidad del comité del programa y se enviará a los postulantes 24 hrs antes. En la evaluación de la presentación y defensa del artículo científico participarán académicos del comité y del claustro. Igualmente, en la evaluación de la entrevista participaran académicos del comité y del claustro. El curriculum (trayectoria académica) de los postulantes se evaluará considerando su participación en publicaciones científicas, congresos, cartas de recomendación, ayudantías y participación en actividades de difusión científica. La ponderación de cada uno de los aspectos a considerar es la siguiente:

Examen de admisión (30%).

Presentación de artículo científico (15%).

Nota de licenciatura/Magíster (20%).

Entrevista (10%).

Publicaciones (6%).

Ayudantías (5%).

Cartas recomendación (5%).

Congresos (6%).

Difusión (3%).

El postulante deberá obtener en el examen de admisión y en la presentación del artículo científico un mínimo de nota 5 en cada evaluación. Cumplidos el criterio anterior, el postulante deberá obtener una ponderación mínima de un 60% considerando todos los aspectos indicados.

Plan de estudios

Malla curricular

Listado de asignaturas del plan de estudios.

Básica

Bioquímica avanzada i
5 créditos
Asignatura teórica que actualiza el conocimiento para la comprensión y análisis de los procesos bioquímicos a nivel molecular.
Bioquímica avanzada ii
5 créditos
Asignatura teórica, que tiene como objetivo analizar los mecanismos que, a nivel molecular, operan en los procesos de organización y expresión del material genético. La asignatura comprende clases expositivas, resolución de problemas, discusión y análisis de trabajos publicados en revistas de la especialidad, presentación de artículos sobre tópicos especiales previamente preparados por cada uno de los estudiantes
Bioinformática y estructura de macromoléculas
5 créditos
Curso teórico-práctico que consiste en clases expositivas donde se expondrán las bases teóricas que sustentan las metodologías bioinformáticas y actividades prácticas conducentes a conocer, aplicar, discutir y comparar metodologías bioinformáticas.
Análisis multi omico de datos biológicos
5 créditos
Asignatura teórico-práctica que introduce al estudiante en el análisis bioinformático de datos omicos. La asignatura está fundamentalmente enfocada en el diseño y aplicación de un protocolo bioinformático para el procesamiento, análisis e interpretación de datos omicos.
Unidad de investigación i
2 créditos
Participación de un estudiante en una investigación dirigida por un profesor del programa, empleando métodos bioinformáticos, para abordar un problema específico, que puede constituir o no el inicio de su tema de tesis de grado
Unidad de investigación ii
2 créditos
Participación de un estudiante en una investigación dirigida por un profesor del programa utilizando metodologías Bioquímicas y Bioinformáticas para abordar un problema específico que constituya el inicio de su trabajo de tesis.
Seminario bibliográfico i
1 créditos
La asignatura consiste en la búsqueda de un tema biológico específico y su análisis en profundidad, mediante la búsqueda bibliográfica, lectura y discusión de publicaciones científicas actualizadas. El problema biológico es elegido por el estudiante de primer año de magíster, estimulando una búsqueda relacionada con el tema de tesis.
Formulación de proyecto
3 créditos
La asignatura consiste en elaborar un proyecto de tesis doctoral en el marco de las áreas de la Bioquímica y la Bioinformática. El estudiante deberá construir el marco teórico de su proyecto, elaborar una pregunta de investigación, una hipótesis que responda la pregunta, un objetivo general y objetivos específicos. Deberá explicitar con detalle la metodología necesaria para alcanzar cada objetivo específico.
Tesis
150 créditos
Asignatua en la que el(la) estudiante desarrolla un trabajo de investigación exhaustivo que aborda cuestiones fundamentales que involucran la biología molecular, la bioquímica y la bioinformática. En esta asignatura, se espera que el estudiante demuestre un profundo conocimiento de los principios bioquímicos y las herramientas bioinformáticas utilizadas para analizar datos biológicos a nivel molecular. Se espera que el estudiante realice experimentos, desarrollen modelos computacionales y proponga nuevas hipótesis que contribuyan al avance de la investigación que desarrolla

Especialidad

Físico química de proteínas
2 créditos
Asignatura teórica de especialidad diseñada para profundizar en los principios teóricos de la Biofísica Molecular, las metodologías utilizadas y sus aplicaciones.
Teoría y práctica en enzimología
3 créditos
Se trata de una asignatura teórica, en la que se analizan los aspectos termodinámicos, moleculares y cinéticos de la catálisis enzimática, y la determinación de constantes de disociación de complejos enzima-inhibidor y proteína-ligando en general.
Ingeniería de proteínas
3 créditos
Asignatura teórica orientada al estudio de los métodos de diseño, obtención y análisis de proteínas para su aplicación en proyectos de investigación.
Ciclo celular y cáncer
2 créditos
Asignatura teórica que introduce al estudiante en los mecanismos moleculares del ciclo celular y en los mecanismos implicados en el desarrollo del cáncer. Al finalizar el curso, el alumno deberá comprender los mecanismos básicos que regulan la proliferación celular en células normales y cancerosas. La asignatura comprende clases expositivas, resolución de problemas, discusión y análisis de trabajos publicados en revistas de la especialidad, presentación de artículos sobre tópicos especiales previamente preparados por cada uno de los estudiantes.
Procesos neurodegenerativos: aspectos moleculares y bioquímicos
2 créditos
El estudiante deberá recolectar, estudiar y comprender la bibliografía relevante acerca de un tema en particular en el área de los procesos neurodegenerativos, con especial énfasis en aspectos moleculares y bioquímicos. En base a esto, el estudiante deberá plantearse una interrogante y resolverla en base a esta literatura. El estudiante deberá aportar una visión crítica a la problemática e introducirse en términos teóricos en las principales técnicas involucradas.
Neurofarmacología molecular estructural
2 créditos
El estudiante deberá recolectar, estudiar y comprender la bibliografía relevante acerca de un tema en particular en el área de la neurofarmacología molecular y estructural. En base a esto, el estudiante deberá plantearse una interrogante y resolverla en base a esta literatura. El estudiante deberá aportar una visión crítica a la problemática e introducirse en términos teóricos en las principales técnicas involucradas.
Simulación de dinámica molecular
3 créditos
Esta asignatura es de carácter teórico-práctico y tiene como principal objetivo entregar habilidad de comprensión y análisis de la dinámica molecular involucrada en las interacciones de fármacos con blancos terapéuticos. En las clases expositivas y prácticas se adquirirán destrezas y habilidades para comprender la dinámica molecular de interacción de fármacos, principalmente de moléculas pequeñas y blancos terapéuticos de carácter proteico.
Diseño de fármacos asistido por computadora (difac)
3 créditos
El curso de diseño de fármacos asistido por computadora (DiFAC) es de carácter teórico-práctico y tiene como principal objetivo presentar herramientas computacionales para optimizar los procesos de diseño, optimización y selección de compuestos bioactivos con potencial terapéutico. DiFAC forma parte de un esfuerzo multidisciplinario con aplicación en diferentes etapas del proceso de diseño de fármacos. Tiene cada vez un papel más protagónico en la investigación que se hace en las Universidades y centros de investigación, así como en el sector privado y la industria farmacéutica.
Modelamiento molecular y termodinámica de sistemas biológicos
3 créditos
Esta asignatura es de carácter teórico-práctico y tiene como principal objetivo relacionar las interacciones moleculares con propiedades termodinámicas macroscópicas de sistemas biológicos asociadas a su funcionamiento. Los conocimientos adquiridos se aplicarán determinando afinidades de sistemas proteína-ligando a través de simulaciones computacionales.
Genómica comparativa y funcional
2 créditos
Asignatura teórica de especialidad que introduce al estudiante a la genómica y la comparación de genomas desde un punto de vista evolutivo y funcional. Al finalizar el curso, se espera que el(la) alumno(a) pueda comprender los mecanismos básicos que explican por qué los organismos varían como consecuencia de las variaciones en su material genético. Además, se espera que el(la) alumno(a) obtenga el conocimiento de cómo hacer interpretaciones ecológicas y evolutivas de las características fenotípicas a partir del análisis de la información genómica y fenómica. La asignatura comprende clases expositivas, resolución de problemas, discusión y análisis de trabajos publicados en revistas de la especialidad, presentación de artículos sobre tópicos relevantes previamente preparados por cada uno(a) de los(as) estudiantes.
Protein characterization and interaction studies: advanced biophysical techniques
2 créditos
La Escuela de Verano titulada “Protein Characterization and Interaction Studies: Advanced Biophysical Techniques” está orientada a enseñar de manera teórico-práctica las herramientas necesarias para caracterizar proteínas obtenidas principalmente de manera recombinante, a través de técnicas espectroscópicas (absorción, fluorescencia, CD y DLS). Junto a lo anterior, se entregarán herramientas teóricas respecto al diseño experimental para el estudio de las interacciones proteína-proteína y proteína-ligando usando técnicas como SPR. Este curso es relevante por una creciente demanda de proteínas recombinantes ya sea como biofármacos o para estudios en experimentos de ciencias básicas. En ambos casos, es necesario poseer certeza que los batch de producción de proteínas no han sufrido alteraciones y que estas son capaces de reconocer su blanco o ser moduladas por ligandos.

Líneas de investigación

Áreas de trabajo de la investigación del programa

Esta línea de investigación estudia las bases moleculares de los fenómenos biológicos a través del análisis de las moléculas y macromoléculas que participan en los procesos celulares. Es una disciplina transversal e integrativa donde se estudian las bases moleculares de los catalizadores biológicos, el metabolismo, la bioenergética, la síntesis y manipulación de ADN y ARN, clonamiento, bases moleculares de enfermedades, etc. Está asociada a la biología celular, la fisiología molecular, la farmacología molecular, la biología del desarrollo, explicando cada proceso a nivel molecular.

Esta línea integra elementos bioinformáticos para resolver problemáticas de índole biológico tales como la estructura y función de macromoléculas, el análisis de datos genómicos, transcriptómicos, proteómicos y metabolómicos. Estas herramientas permiten analizar interacciones proteína–ligando, proteína-proteína y también diseñar fármacos para dilucidar alternativas terapéuticas contra diversas enfermedades, junto con la secuenciación, cuantificación e integración de datos masivos de perfiles de expresión de ARN, regulación de expresión génica, proteínas, y metabolitos en las células y/o tejidos bajo diferentes condiciones ambientales.

Director/a del programa

Elena Amparo Uribe Pérez

AURIBE@UDEC.CL

Cuerpo Académico

Docentes del Programa

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JOSÉ ANTONIO MARTÍNEZ OYANEDEL

COLABORADOR

Campus

Concepcion

Modalidad

Presencial

Duración

8 Semestres

Horario

Diurna

Contacto

Datos de Contacto

Contamos con un equipo dedicado para orientarte en el proceso de postulación y responder tus consultas.

Margareth Del Carmen Santana

Secretaría

msantana@udec.cl

Paula Roxana Veloso

Secretaría

pauveloso@udec.cl

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¿Qué es este programa de postgrado?

El programa de doctorado es de carácter diurno y presencial, tiene una duración de 4 años distribuidos en 8 semestres y es de dedicación exclusiva. En el plan de estudios del programa se han considerado asignaturas de tipo básicas y de especialidad, desarrollando en paralelo la formación en Bioquímica y en Bioinformática. El 1er año el estudiante realiza 2 asignaturas básicas relacionadas con el área Bioquímica y 2 relacionadas al área Bioinformática. También, en el primer año realiza un seminario Bibliográfico y 2 Unidades de investigación, donde el estudiante elige, de acuerdo a sus intereses, en qué tópicos y con qué tutor va a desarrollar el seminario y en qué laboratorio va a desarrollar sus unidades de Investigación. Las Unidades de Investigación deben involucrar el desarrollo de expertises tanto del área Bioquímica como Bioinformática.

¿Qué requisitos necesito para postular?

Estos criterios de selección son acordes con el reglamento de los programas de Doctorado y Magíster 2022-067 de la Universidad de Concepción. Para la selección de los postulantes, se evaluarán sus conocimientos a través de un examen de admisión y la presentación de una publicación científica en el área de la Bioquímica y la Bioinformática. Para conocer los intereses y expectativas de los postulantes se realizará una entrevista personal. La elaboración y evaluación del examen de admisión será responsabilidad del comité del programa, el examen tendrá un 60% de exigencia y distintos tipos de preguntas. La elección del/los artículos/os científico/s (si es más de uno va a depender del número de postulantes y como se calendarizan las presentaciones), será responsabilidad del comité del programa y se enviará a los postulantes 24 hrs antes. En la evaluación de la presentación y defensa del artículo científico participarán académicos del comité y del claustro. Igualmente, en la evaluación de la entrevista participaran académicos del comité y del claustro. El curriculum (trayectoria académica) de los postulantes se evaluará considerando su participación en publicaciones científicas, congresos, cartas de recomendación, ayudantías y participación en actividades de difusión científica. La ponderación de cada uno de los aspectos a considerar es la siguiente: Examen de admisión (30%). Presentación de artículo científico (15%). Nota de licenciatura/Magíster (20%). Entrevista (10%). Publicaciones (6%). Ayudantías (5%). Cartas recomendación (5%). Congresos (6%). Difusión (3%). El postulante deberá obtener en el examen de admisión y en la presentación del artículo científico un mínimo de nota 5 en cada evaluación. Cumplidos el criterio anterior, el postulante deberá obtener una ponderación mínima de un 60% considerando todos los aspectos indicados.

¿A quién está dirigido?

Profesionales que buscan avanzar en su carrera, fortalecer liderazgo y adquirir herramientas de gestión y análisis aplicadas.

Doctorado en Bioquímica y Bioinformática

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3 lugar

11 lugar

¿Por qué elegir este programa?

Objetivo general

¿Qué lograrás?

Perfil del Graduado/a

Objetivos Específicos

Requisitos de Admisión

Malla curricular

Básica

Especialidad

Líneas de investigación

Elena Amparo Uribe Pérez

Docentes del Programa

Claustro

ALEXIS MARCELO SALAS BURGOS

ARIEL FERNANDO CASTRO ALMA

CARLOS FELIPE BURGOS ARIAS

DAVID MAURICIO RAMIREZ SANCHEZ

ELENA AMPARO URIBE PÉREZ

ESTEFANÍA SALOMÉ TARIFEÑO SALDIVIA

FELIPE ELEANDER AGUILERA MUÑOZ

GONZALO ENRIQUE YÉVENES CRISÓSTOMO

GUSTAVO ALONSO MORAGA CID

JORGE ROBERTO TOLEDO ALONSO

JOSE LEONARDO GUZMAN GONZALEZ

JOSÉ LEONARDO GUTIÉRREZ CONTRERAS

LUIS GERARDO AGUAYO HERNÁNDEZ

MAXIMILIANO FRANCISCO FIGUEROA YÉVENES

PATRICIO ALEJANDRO CASTRO MALDONADO

ROXANA JACQUELINE PINCHEIRA BARRERA

WALTER ALFONSO RABANAL LEON

Colaboradores

ESTEBAN VÖHRINGER-MARTÍNEZ

FELIPE ANDRÉS ZÚÑIGA ARBALTI

FERNANDO JAVIER SEPÚLVEDA BRICEÑO

JOSÉ ANTONIO MARTÍNEZ OYANEDEL

MABEL ANGÉLICA VIDAL MIRANDA

MARCELA ELIANA TORREJON QUEZADA

RODRIGO HERNÁN RECABARREN HURTADO

TERESA CAPRILE ELOLA-OLASO

VIOLETA MARILYN DEL CARMEN MORIN MUÑOZ

Información del programa